始建于清光绪年间的吉林中等农学堂，在民国和伪满时期，虽几经易名，数度搬迁，但始终没有偏离培养农业人才的初衷。

民国二年（1913年），国民政府将官办中等农学堂改为吉林省立甲种农业学校，民国四年（1915年），改称吉林省立甲种农工业学校，到民国十年（1921年）时，已有农业科学生166名，工业科学生37名。民国十二年（1923年），改为省立第五中学校。伪满康德三年（1936年），吉林省立吉林农业学校恢复成立，校址在东局子。

康德四年（1937年），日本军国主义者为强化殖民主义教育，又颁布了所谓的“新学制”，学校被迫纳入了殖民地奴化教育，但坚守农业初心未改。康德五年（1938年）旧制吉林省立吉林农业学校改名为吉林省立吉林第一国民高等学校（农科），校址迁往省城吉林市西关外八百垄。民国三十四年8月（1945年），抗战胜利后，学校改称吉林农科职业学校。民国三十五年5月（1946年），国民党当局将吉林农科职业学校与省立斋斋农林学校合并，称省立吉林农林职业学校与分校。1948年3月吉林市解放，人民政府在接管国民党时期吉林省立农科职业学校的基础上，成立吉林省立农业学校，由建设厅厅长徐元泉同志来校正式接管，负责办学，教育厅派安文则同志任学校第一任校长。

在整顿学生思想过程中，由于盘踞长春的国民党军队经常派飞机轰炸吉林市，散发传单进行反动宣传，对学生干扰极大。为了稳定师生思想，学校改变教学方法，学习"抗大式"的办学精神，为避免空袭，有时在树林里席地而坐听专业讲座（因当时无教室）和领导报告，徐元泉同志曾几次在树丛中给师生作政治形势报告。5月8日，学校从省城西关外八百垄迁至吉林市九站农业试验场（即现在的吉林市农业科学院），场校合并。

实行科研与教学相结合，当时学校有农、畜两科的学生100名，教职工12名。当时人民政府包伙食费、提供衣、帽、鞋和学习生活费，按学生当时每人的具体情况，逐季按月统一发给学生。

1949年初场校分家，吉林省政府将原省立农业学校正式改为吉林省立农业专门学校。

校内分设农学科、畜产兽医科、农田水利科。修业年限为四年，从本年起开始招生，以培养新民主主义教育下的农业专门技术人才。当年招收解放后的第一批学生，新生入学后，实行定额包干供给制，每个学生每月发给70分，40分做伙食费用，剩余30分作为每个学生生活用品等支出。当年在校学生达243人，并有毕业生47人，是解放后吉林省最早的一批农牧专业毕业生。当时有校舍206间，土地28公顷，图书2300册，仪器77件，并有少量猪、牛、鸡、兔等。同年冬天，学校由九站迁往吉林市江桥之南（现江南公园）。